Variante da Subunidade Beta 3 da Proteína G ( GNB3 ) Está Associada a Alterações Bioquímicas em Pacientes Brasileiros com Hipertensão / G Protein Subunit Beta 3 (GNB3) Variant Is Associated with Biochemical Changes in Brazilian Patients with Hypertension

Resumo Fundamento Genes e suas variantes associadas a fatores ambientais contribuem para o desenvolvimento do fenótipo hipertenso. O gene da subunidade beta 3 da proteína G ( GNB3 ) está envolvido no processo de sinalização intracelular e suas variantes têm sido relacionadas à suscetibilidade à hipertensão arterial. Objetivo Determinar a associação da variante GNB3 (rs5443:C>T) com a hipertensão arterial, parâmetros bioquímicos, idade e obesidade em indivíduos hipertensos e normotensos de Ouro Preto, Minas Gerais. Método A identificação das variantes foi realizada por PCR em tempo real, utilizando o sistema TaqMan®, em amostras de 310 pacientes (155 hipertensos e 155 normotensos). Análises bioquímicas (função renal, perfil lipídico e glicemia) foram realizadas a partir do soro por meio de espectrofotometria UV/Vis e eletrodo íon-seletivo. Foi utilizado um modelo de regressão logística múltipla para identificar fatores associados à hipertensão arterial. A análise das variáveis contínuas com distribuição normal foi realizada usando o teste t de Student não pareado; dados não normais foram analisados usando o teste de Mann-Whitney. Valores de p < 0,05 foram considerados significativos. Resultados A variante rs5443:C>T não esteve associada à hipertensão arterial na população avaliada (p = 0,88). Em relação às medidas bioquímicas, o alelo T esteve associado a níveis elevados de triglicerídeos, glicose e ácido úrico em indivíduos hipertensos (p < 0,05). Conclusão Os presentes resultados mostram a importância do diagnóstico genético para prevenir as causas e consequências de doenças e sugerem que a variante GNB3 rs5443:C>T pode estar associada a alterações no perfil bioquímico em indivíduos hipertensos.

Abstract Background Genes and their variants associated with environmental factors contribute to the development of the hypertensive phenotype. The G protein beta 3 subunit gene (GNB3) is involved in the intracellular signaling process, and its variants have been related to susceptibility to arterial hypertension. Objective To determine the association of the GNB3 variant (rs5443:C>T) with arterial hypertension, biochemical parameters, age, and obesity in hypertensive and normotensive individuals from Ouro Preto, Minas Gerais, Brazil. Method The identification of variants was performed by real-time PCR, using the TaqMan® system, in 310 samples (155 hypertensive and 155 normotensive). Biochemical analyses (renal function, lipid profile and glycemia) were performed from the serum using UV/Vis spectrophotometry and ion-selective electrode. A multiple logistic regression model was used to identify factors associated with arterial hypertension. The analysis of continuous variables with normal distribution was performed using the unpaired Student's t test; non-normal data were analyzed using Mann-Whitney. P < 0.05 was considered significant. Results The rs5443:C>T variant was not associated with arterial hypertension in the evaluated population (p = 0.88). Regarding biochemical measures, the T allele was associated with high levels of triglycerides, glucose and uric acid in hypertensive individuals (p < 0.05). Conclusion These results show the importance of genetic diagnosis to prevent the causes and consequences of diseases and imply that the GNB3 rs5443:C>T variant may be associated with changes in the biochemical profile in hypertensive individuals.

FMR1 alleles in women with idiopathic infertility / Alelos do gene FMR1 em mulheres com infertilidade idiopática

INTRODUCTION: The frequency of the premutation alleles of the FMR1 gene varies from 1:100 to 1:260 Israeli, Canadian, Finnish and American women, but it is unknown in Brazil. Premutation carriers may have reduced reproductive age and are at risk of transmitting the expanded allele to their offspring, and consequently fragile X syndrome. OBJECTIVE: To observe the distribution range of the FMR1 gene alleles in a population of women with idiopathic infertility, without symptoms of premature ovarian insufficiency. METHODS: The presence of premutation in FMR1 was assessed by conventional PCR, agarose, and acrylamide gel and analysis of fragments in capillary electrophoresis. Lymphocyte DNA obtained from 283 women undergoing infertility treatment was analyzed. RESULTS: 169 patients had the normal heterozygous allele (59.7%), 114 had the normal homozygous allele (40.6%) and no patient had the premutation. Premature ovarian insufficiency is seen in 20 to 30% of women with the permutated allele. Thus, the condition can be asymptomatic in a large part of the premutation carriers. Brazil has a diverse population and, therefore, the allele frequencies of many gene variants are unknown. Previous Brazilian studies have shown a low frequency of the premutation allele in different patient cohorts. Corroborating these articles, the results demonstrated that the frequency of the premutation allele is low in the infertile women population studied. CONCLUSION: Tracking the size of the FMR1 gene alleles allows the expansion of knowledge about the frequency of risk alleles associated with genetic diseases in the Brazilian population.

INTRODUÇÃO: A frequência dos alelos pré-mutados do gene FMR1 varia de 1:100 e 1:260 mulheres israelenses, canadenses, finlandesas e americanas, mas é desconhecida no Brasil. Portadoras da pré-mutação podem apresentar redução da idade reprodutiva e possuem risco de transmissão do alelo expandido para a prole, e consequentemente a Síndrome do X frágil. OBJETIVO: Observar a faixa de distribuição dos alelos do gene FMR1 em uma população de mulheres com infertilidade idiopática, sem sintomas de insuficiência ovariana prematura. MÉTODOS: A presença da pré-mutação em FMR1 foi avaliada por PCR convencional, gel de agarose e acrilamida e análise de fragmentos em eletroforese capilar. Analisou-se DNA de linfócitos obtidos de 283 mulheres em tratamento de infertilidade. RESULTADOS: Foi observado que 169 pacientes apresentam o alelo heterozigoto normal (59,7%), 114 apresentam o alelo homozigoto normal (40,6%) e nenhuma paciente apresentou a pré-mutação. A insuficiência ovariana prematura é observada em 20 a 30% das mulheres portadoras do alelo pré-mutado. Assim, a presença de um alelo pré-mutado pode ser assintomática em grande parte dos casos. O Brasil possui uma população diversificada e, portanto, as frequências alélicas de muitas variantes gênicas são desconhecidas. Estudos brasileiros anteriores mostraram uma baixa frequência do alelo pré-mutado em diferentes coortes de pacientes. Corroborando estes autores, os resultados demonstram que frequência do alelo pré-mutado é baixa na população de mulheres inférteis estudada. CONCLUSÃO: O rastreamento do tamanho dos alelos do gene FMR1 permite ampliar o conhecimento sobre a frequência dos alelos de risco para doenças genética na população brasileira.

Era-like GTP protein gene expression in rice / Expressão do gene da proteína GTP semelhante à era no arroz

The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Era-like GTP protein gene expression in rice

Abstract The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Resumo Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Era-like GTP protein gene expression in rice / Expressão do gene da proteína GTP semelhante à era no arroz

The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Evaluating surrogates of genetic diversity for conservation planning.

Protected-area systems should conserve intraspecific genetic diversity. Because genetic data require resources to obtain, several approaches have been proposed for generating plans for protected-area systems (prioritizations) when genetic data are not available. Yet such surrogate-based approaches remain poorly tested. We evaluated the effectiveness of potential surrogate-based approaches based on microsatellite genetic data collected across the Iberian Peninsula for 7 amphibian and 3 reptilian species. Long-term environmental suitability did not effectively represent sites containing high genetic diversity (allelic richness). Prioritizations based on long-term environmental suitability had similar performance to random prioritizations. Geographic distances and resistance distances based on contemporary environmental suitability were not always effective surrogates for identification of combinations of sites that contain individuals with different genetic compositions. Our results demonstrate that population genetic data based on commonly used neutral markers can inform prioritizations, and we could not find an adequate substitute. Conservation planners need to weigh the potential benefits of genetic data against their acquisition costs.

Evaluación de los Sustitutos de la Diversidad Genética para la Planeación de la Conservación Resumen Los sistemas de áreas protegidas deberían conservar la diversidad genética intraespecífica. Ya que para obtener datos genéticos se requieren recursos, se han propuesto distintas estrategias para generar los planes para los sistemas de áreas protegidas (priorizaciones) cuando los datos genéticos no están disponibles. A pesar de lo anterior, dichas estrategias basadas en sustitutos han sido poco evaluadas. Evaluamos la efectividad del potencial de las estrategias basadas en sustitutos cuya base son los datos genéticos de microsatélites obtenidos en toda la Península Ibérica y correspondientes a siete especies de anfibios y a tres de reptiles. La idoneidad ambiental a largo plazo no representó efectivamente los sitios que contienen una diversidad genética alta (riqueza de alelos). Las priorizaciones basadas en la idoneidad ambiental a largo plazo tuvieron un desempeño similar a las priorizaciones aleatorias. Las distancias geográficas y las distancias de resistencia basadas en la idoneidad ambiental contemporánea no siempre fueron sustitutos efectivos para la identificación de las combinaciones de sitios que contienen individuos con composiciones genéticas diferentes. Nuestros resultados demuestran que los datos genéticos de una población basados en marcadores neutrales de uso común pueden informar a las priorizaciones y que no pudimos encontrar un sustituto adecuado. Los planificadores de la conservación necesitan sopesar los beneficios potenciales de los datos genéticos contra sus costos de adquisición.

Hipercolesterolemia familiar: serie de 36 casos con fenotipo de hipercolesterolemia familiar homocigótica / Familial hypercholesterolaemia: A study of 36 cases with a phenotype of homozygous familiar hypercholesterolaemia

Resumen Introducción: La hipercolesterolemia familiar homocigótica (HFHo) se caracteriza por niveles muy elevados de cLDL y por enfermedad aterosclerótica temprana. Aunque la frecuencia es baja (1/300.000), las complicaciones son muy severas y pueden ser evitadas. Encontrar y tratar esta población de manera temprana podría reducir la mortalidad. Se describen 36 casos en Colombia, en donde se calcula que haya entre 160 y 200 casos. Resultados: Un total de 36 pacientes con fenotipo sugestivo de HFHo fueron identificados y tratados en un período de observación de cuatro años. La media de edad fue 27 años (24 mujeres). 34 pacientes tuvieron un puntaje según la Red de Clínicas de Lípidos de Holanda (RCLH) mayor de 8 (diagnóstico definitivo) y los restantes 2 tenían puntaje equivalente a diagnóstico probable. Un cuarto de los casos procedían de la costa norte colombiana. En las pruebas genéticas, 14 fueron homocigóticos verdaderos para mutación del gen que codifica para el receptor de LDL (LDLR), 12 heterocigóticos compuestos, 2 heterocigóticos dobles y uno autosómico recesivo (LDLRAP1); 5 pacientes fueron heterocigóticos simples (LDLR) y 2 pacientes no autorizaron la prueba. En los homocigóticos verdaderos, la variante más frecuente encontrada fue la c.11G>A. 14 pacientes cursaron con enfermedad coronaria, 9 con estenosis carotídea, 8 con estenosis aórtica y 2 tuvieron ataques cerebrovasculares (ACV). 34 pacientes recibían estatinas (24 rosuvastatina), 30 recibían ezetimibe, 2 recibían evolocumab y 20 recibían lomitapide (dosis promedio 12,7mg). Ninguno recibió aféresis de cLDL. Los medicamentos, en general, fueron bien tolerados y la reducción promedio de cLDL con la terapia fue de 533,7mg/dl a 245,1mg/dl (54%). Conclusiones: Todos los pacientes recibieron tratamiento hipolipemiante y se encontraron alteraciones genéticas diagnósticas en todos aquellos que autorizaron el examen. Los niveles elevados de cLDL conllevan tanto riesgo que el tratamiento debe establecerse aún sin conocer el diagnóstico genético.

Abstract Background: Homozygous familial hypercholesterolemia (HoFH) is characterized for very high levels of cLDL and early cardiovascular disease. Although incidence is low (1/300 000), complications are very severe and can be avoided. Finding and treating this population promptly could reduce mortality. We describe 36 cases in Colombia, where 160 to 200 cases are expected. Results: 36 patients with phenotype of HoHF were identified and treated in a follow-up of 4 years. The mean age was 27 years (24 women). 34 of them had at least 8 points in the FH Dutch Lipid Clinic Criteria (definitive diagnosis) and two had probable diagnosis. A quarter of the cases came from the Colombian North Coast. In molecular tests, 14 were true homozygous for LDLR, 12 were compound heterozygous for LDLR, 2 double heterozygous and one was autosomal recessive; 5 were heterozygous and 2 patients did not authorized genetic test. In true homozygous subjects, the most frequent variant was c.11G>A. 14 patients had coronary disease, 9 carotid stenosis, 8 aortic stenosis and 2 had stroke. 34 patients were on statins (25 rosuvastatin), 30 were receiving ezetimibe, 2 were receiving a PSCK9 inhibitor (evolocumab) and 20 were on lomitapide with mean doses of 12.7mg. None received lipoprotein apheresis. Medications were very well tolerated. Changes in cLDL after therapy was from 533.7 mg/dL to 245 mg/dL, (54%). Conclusions: Treatment was started in all patients. We found genetic mutations in all patients with genetic tests. The high levels of cLDL mean such a high risk that treatment must be started promptly, even without a genetic test.

Meta-analysis of the differential effects of habitat fragmentation and degradation on plant genetic diversity.

Genetic diversity is a key factor for population survival and evolution. However, anthropogenic habitat disturbance can erode it, making populations more prone to extinction. Aiming to assess the global effects of habitat disturbance on plant genetic variation, we conducted a meta-analysis based on 92 case studies obtained from published literature. We compared the effects of habitat fragmentation and degradation on plant allelic richness and gene diversity (equivalent to expected heterozygosity) and tested whether such changes are sensitive to different life-forms, life spans, mating systems, and commonness. Anthropogenic disturbance had a negative effect on allelic richness, but not on gene diversity. Habitat fragmentation had a negative effect on genetic variation, whereas habitat degradation had no effect. When we examined the individual effects in fragmented habitats, allelic richness and gene diversity decreased, but this decrease was strongly dependent on certain plant traits. Specifically, common long-lived trees and self-incompatible species were more susceptible to allelic richness loss. Conversely, gene diversity decreased in common short-lived species (herbs) with self-compatible reproduction. In a wider geographical context, tropical plant communities were more sensitive to allelic richness loss, whereas temperate plant communities were more sensitive to gene diversity loss. Our synthesis showed complex responses to habitat disturbance among plant species. In many cases, the absence of effects could be the result of the time elapsed since the disturbance event or reproductive systems favoring self-pollination, but attention must be paid to those plant species that are more susceptible to losing genetic diversity, and appropriate conservation should be actions taken.

Meta-Análisis de los Efectos Diferenciales de la Fragmentación y Degradación del Hábitat sobre la Diversidad Genética de las Plantas Resumen La diversidad genética es un factor clave para la supervivencia y evolución de las poblaciones. Sin embargo, la perturbación antropogénica de los hábitats puede dañar esta diversidad, volviendo a las poblaciones más susceptibles a la extinción. Con el objetivo de evaluar los efectos globales de la perturbación del hábitat sobre la variación genética de las plantas, realizamos un meta-análisis basado en 92 estudios de caso obtenidos de la literatura publicada. Comparamos los efectos de la degradación y fragmentación del hábitat sobre la riqueza de alelos y la diversidad de genes (equivalente a la heterocigosidad esperada) de las plantas y probamos si dichos cambios son sensibles para diferentes formas de vida, tiempos de vida, sistemas de apareamiento y preponderancia. La perturbación antropogénica tuvo un efecto negativo sobre la riqueza de alelos, pero no sobre la diversidad genética. La fragmentación del hábitat tuvo un efecto negativo sobre la variación genética, mientras que la degradación del hábitat no tuvo efecto. Cuando examinamos los efectos individuales en los hábitats fragmentados, la riqueza de alelos y la diversidad genética disminuyeron, pero esta disminución estuvo vinculada fuertemente con ciertas características de las plantas. Específicamente, los árboles de larga vida y las especies auto-incompatibles fueron más susceptibles a la pérdida de la riqueza de alelos. De manera contraria, la diversidad genética disminuyó en especies comunes de vida corta (hierbas) con reproducción auto-compatibles. En un contexto geográfico más amplio, las comunidades de plantas tropicales fueron más sensibles a la pérdida de la riqueza de alelos, mientras que las comunidades de plantas de zonas templadas fueron más sensibles a la pérdida de diversidad de genes. Nuestra síntesis mostró respuestas complejas a la perturbación del hábitat entre las especies de plantas. En muchos casos, la ausencia de efectos podría ser el resultado del tiempo transcurrido desde el evento de perturbación o los sistemas reproductivos que favorecen la auto-polinización, pero se le debe prestar atención a aquellas especies de plantas que son más susceptibles a la pérdida de la diversidad genética, para así poder realizar las acciones de conservación apropiadas.

Canine POMC deletion (P187fs) allele frequency in Labrador Retrievers in Brazil / Frequência de alelos mutados (P187fs) no POMC de cães Labrador Retriever no Brasil

The Labrador Retriever is among the main breeds with the greatest predisposition to obesity. Several factors, especially the interrelationships between food management, exercise and social factors; influence the likelihood of a dog becoming obese. Furthermore, genetic factors are also responsible for obesity in dogs, and in Labrador Retriever, a frameshift mutation (P187fs) in pro-opiomelanocortin (POMC) gene is strongly associated with obesity. There is no knowledge of studies that have previously evaluated the prevalence of the canine POMC deletion (P187fs) in Brazilian Labrador Retriever. Therefore, the objective of this study was to investigate this mutation in Labrador Retriever dogs in Brazil. Of the 108 Labrador Retrievers that were assessed in this study, 59 were from a previous study, composed by animals assisted in a veterinary hospital with unknown lineage, and 49 were from a prospective study, composed of 19 pet and 30 assistance/rescue Labrador Retriever dogs. The obesity risk and appetite questionnaire were applied, with some modifications, to tutors of the animals used in the prospective study. Fragments of the DNA, containing the mutation, were amplified by PCR and submitted to direct gene sequencing. The allele frequency of the mutation was 21.3% and was out of Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). Using only the data of animals with known lineage, the presence of the mutated allele was higher in the Assistance/rescue Group than Pet Group (P<0.01), furthermore, the allele frequencies observed in Assistance Group (31.7%) was out of Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05), while that in the Pet Group (18.4%) was in equilibrium (P>0.05). Although the mutation has increased the food-motivation in the assistance/rescue dogs, other variables, especially frequent exercising, favored that these animals maintained the ideal body weight (body condition score = 5). In summary, the Hardy-Weinberg disequilibrium observed in the allele distribution of the deletion POMC_P187fs in this study, independently of the Labrador Retriever group assessed, suggesting the possibility of positive selection of the mutated allele, which may lead to the maintenance of this deleterious allele in the studied population.(AU)

O Labrador Retriever é uma das principais raças caninas com maior predisposição à obesidade. Vários fatores, especialmente as interrelações entre a alimentação, exercício e fatores sociais, influenciam a probabilidade de um cão se tornar obeso. Além disso, fatores genéticos são também responsáveis pela obesidade em cães, e no Labrador Retriever a mutação "frameshift" P187fs no gene pró-opiomelanocortina (POMC) está fortemente associada à obesidade. Não existem estudos prévios de prevalência da deleção P187fs no gene POMC em cães Labrador Retriever no Brasil. Portanto, o objetivo deste estudo foi investigar esta mutação em cães da raça Labrador Retriever no Brasil. Dos 108 Labradores Retrievers avaliados neste estudo, 59 eram de um estudo retrospectivo (composto por animais atendido no hospital veterinário e sem linhagem conhecida) e 49 eram de um estudo prospectivo (composto por 19 cães pet e 30 cães de assistência/resgate). Um questionário de risco de obesidade modificado foi aplicado nos tutores dos animais usados no estudo prospectivo. Fragmentos de DNA, contendo a mutação, foram amplificados por PCR e submetidos ao sequenciamento gênico direto. A frequência alélica da mutação foi de 21,3% e estava fora do equilíbrio de Hardy-Weinberg (P<0,05). Usando somente os dados dos animais de linhagem conhecida, a presença do alelo mutado foi maior no Grupo de cães de Assistência/resgate que no Grupo de Pets (P<0,01), além disso, as frequências alélicas nos Grupos de Assistência/resgate (31,7%) e no de pets (18,4%) estavam fora e em equilíbrio de Hardy-Weinberg (P<0,05), respectivamente. Embora a mutação tenha aumentado a motivação pelo alimento em cães Labrador Retriever do Grupo de Assistência/resgate, outras variáveis, especialmente o frequente exercício, favoreceu a manutenção o peso corporal ideal (peso corporal = 5). Em resumo, o desequilíbrio de Hardy-Weinberg observado na distribuição do alelo POMC_P187fs observado neste estudo, independentemente do grupo de Labrador Retriever avaliado, sugere a possibilidade de uma seleção positiva para o alelo mutado, o qual poderá levar a manutenção desse alelo deletério nesta população.(AU)

Alelos HLA más comunes y asociados con riesgo o protección en enfermedad renal crónica de etiología no determinada.

INTRODUCTION: Chronic kidney disease accounts for part of overall health expenditure; a potential etiology is related to variations, absence or presence of some human leukocyte antigen (HLA) alleles. METHOD: An analysis of HLA reports of 1965 kidney recipients with no determined etiology, and 1361 kidney donors was performed. It was carried out with Luminex based in cell flow fluorometry for the A, B, DRB1 and DQA loci. An analysis was performed with contingency tables in order to determine the odds ratio (OR) and confidence intervals (CI). Quantitative analysis was also carried out. RESULTS: Of the 101 alleles found, 13 showed association, 7 with risk for chronic kidney disease, with the most significant being HLA-DR17 with an OR of 3.91 (95 % CI = 2.96-5.17) and the one with the highest significance for protection being HLA-DR9, with an OR of 0.043 (95 % CI = 0.005-0.3224). CONCLUSIONS: It is necessary to understand that kidney diseases can be associated with yet unknown immune processes, where the association of the absence or presence of any allele should be known.

INTRODUCCIÓN: La enfermedad renal crónica representa parte del gasto en salud en general; una potencial etiología es la relacionada con variaciones, ausencia o presencia de algunos alelos del human leucocyte antigen (HLA). MÉTODO: Se realizó el análisis de 1965 reportes de HLA sin etiología determinada y de 1361 donadores renales. Se llevó a cabo tecnología Luminex con base en fluorimetría de flujo celular para los locus A, B, DRB1 y DQA. Se realizó análisis con tablas de contingencia para determinar razón de momios (RM) e intervalos de confianza (IC). Se efectuó análisis cuantitativo. RESULTADOS: De 101 alelos encontrados, 13 presentaron asociación, siete con riesgo para enfermedad renal crónica, de los cuales el más significativo fue HLA-DR17, con RM = 3.91 (IC 95 % = 2.96-5.17), y el de mayor significación de protección fue HLA-DR9, con RM = 0.043 (IC 95 % = 0.005-0.3224). CONCLUSIONES: Es necesario entender que las enfermedades renales pueden estar ligadas a procesos inmunológicos, en los que se tiene que conocer la asociación de la ausencia o presencia de algún alelo.

Alelos HLA más comunes y asociados con riesgo o protección en enfermedad renal crónica de etiología no determinada / Most common HLA alleles associated with risk or protection in chronic kidney disease of undetermined etiology

Resumen Introducción: La enfermedad renal crónica representa parte del gasto en salud en general; una potencial etiología es la relacionada con variaciones, ausencia o presencia de algunos alelos del human leucocyte antigen (HLA). Método: Se realizó el análisis de 1965 reportes de HLA sin etiología determinada y de 1361 donadores renales. Se llevó a cabo tecnología Luminex con base en fluorimetría de flujo celular para los locus A, B, DRB1 y DQA. Se realizó análisis con tablas de contingencia para determinar razón de momios (RM) e intervalos de confianza (IC). Se efectuó análisis cuantitativo. Resultados: De 101 alelos encontrados, 13 presentaron asociación, siete con riesgo para enfermedad renal crónica, de los cuales el más significativo fue HLA-DR17, con RM = 3.91 (IC 95 % = 2.96-5.17), y el de mayor significación de protección fue HLA-DR9, con RM = 0.043 (IC 95 % = 0.005-0.3224). Conclusiones: Es necesario entender que las enfermedades renales pueden estar ligadas a procesos inmunológicos, en los que se tiene que conocer la asociación de la ausencia o presencia de algún alelo.

Abstract Introduction: Chronic kidney disease accounts for part of overall health expenditure; a potential etiology is related to variations, absence or presence of some human leukocyte antigen (HLA) alleles. Method: An analysis of HLA reports of 1965 kidney recipients with no determined etiology, and 1361 kidney donors was performed. It was carried out with Luminex based in cell flow fluorometry for the A, B, DRB1 and DQA loci. An analysis was performed with contingency tables in order to determine the odds ratio (OR) and confidence intervals (CI). Quantitative analysis was also carried out. Results: Of the 101 alleles found, 13 showed association, 7 with risk for chronic kidney disease, with the most significant being HLA-DR17 with an OR of 3.91 (95 % CI = 2.96-5.17) and the one with the highest significance for protection being HLA-DR9, with an OR of 0.043 (95 % CI = 0.005-0.3224). Conclusions: It is necessary to understand that kidney diseases can be associated with yet unknown immune processes, where the association of the absence or presence of any allele should be known.

GENETIC DIVERSITY IN A POPULATION OF CREOLE MAIZE (Zea mays L.) EVALUATED BY MICROSATELLITE MARKERS IN PUERTO LIBERTADOR, CORDOBA / DIVERSIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACIÓN DE MAÍZ CRIOLLO (Zea mays L.) EVALUADA MEDIANTE MARCADORES MICROSATÉLITES EN PUERTO LIBERTADOR, CÓRDOBA

ABSTRACT Maize a plant of Mesoamerican origin, has evolved in different microenvironments, generating the great diversity of maize that exists in the world. In order to determine the genetic diversity of a population of Creole maize, twelve microsatellite markers were evaluated in 30 accessions, in Puerto Libertador, Córdoba. The DNA of each accession was extracted using the PROMEGA kit, the markers were amplified by the PCR technique and the amplicons were run on polyacrylamide gels, the gels were digitalized and the molecular sizes were determined by an exponential model. Results showed a total of 66 alleles and an average of alleles of 5.5, the expected heterozygosity was 0.655, the values of the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.352 to 0.838, with an average of 0.592 and the Hardy-Weinberg equilibrium showed imbalance (p <0.05). This work revealed that the studied accessions of Creole maize showed a high degree of polymorphism, high genetic variability and microsatellite markers were the appropriate for the evaluation of genetic diversity. This information shows to be useful for the conservation and protection of the genetic diversity of the studied Creole Maize.

RESUMEN El maíz una planta de origen mesoamericano, se ha desarrollado en los más variados microambientes, lo que ha generado una gran diversidad de variedades alrededor del mundo. Con el objetivo de determinar la diversidad genética de una población de maíz criollo, se evaluaron doce marcadores microsatélite, en 30 accesiones, en Puerto Libertador, Córdoba. El ADN de cada accesión fue extraído, mediante el kit de PROMEGA; los marcadores se amplificaron, mediante la técnica de PCR y los amplicones, se corrieron en geles de poliacrilamida. Los geles fueron digitalizados y los tamaños moleculares se determinaron, mediante un modelo exponencial. Los resultados mostraron un total de 66 alelos y un promedio de alelos de 5,5; la heterocigosidad esperada fue 0,655. Los valores del contenido de información polimórfica (PIC) variaron de 0,352 a 0,838, con un promedio de 0,592 y la prueba de Hardy-Weinberg mostró desequilibrio (p<0,05). Este trabajo reveló que las accesiones de maíz criollo estudiadas mostraron alto grado de polimorfismo, alta variabilidad genética y los marcadores microsatélites resultaron los apropiados para la evaluación de la diversidad genética. Esta información muestra ser útil para la conservación de la diversidad genética del maíz criollo estudiado y su protección.

Polimorfismos en los genes de la enzima alcohol deshidrogenasa (ADH1) y la citocromo P450 2E1 (CYP2E1) en pacientes con cirrosis y carcinoma hepatocelular / Polymorphisms in alcohol dehydrogenase (ADH1) and cytochrome p450 2E1 (CYP2E1) genes in patients with cirrhosis and/or hepatocellular carcinoma

Introducción. Uno de los principales factores de riesgo del carcinoma hepatocelular es el consumo crónico de alcohol. En estudios en diferentes poblaciones, se sugiere que las variantes genéticas de las enzimas que participan en el metabolismo del alcohol, como la alcohol deshidrogenasa (ADH) y la citocromo P450 (CYP2E1), estarían asociadas con riesgo de enfermedades hepáticas terminales. Objetivo. Identificar y caracterizar las variantes alélicas de los genes ADH1B, ADH1C y CYP2E1 en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Materiales y métodos. Se incluyeron muestras de pacientes atendidos entre el 2005 y el 2007, y entre el 2014 y el 2016, en la unidad de hepatología de un hospital de Medellín. La genotipificación de las muestras se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) con análisis de los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Los resultados se compararon con los de dos grupos de control y con lo reportado en la base de datos del 1000 Genomes Project. Resultados. Se recolectaron 97 muestras de pacientes con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Los dos factores de riesgo más frecuentes fueron el consumo crónico de alcohol (18,6 %) y las colangiopatías (17,5 %). Los genotipos más frecuentes en la población de estudio fueron el ADH1B*1/1 (82 %), el ADH1C*1/1 (59 %) y el CYP2E1*C/C (84 %). Conclusiones. En este primer estudio de los polimorfismos en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular, los genotipos más frecuentes fueron el ADH1B*1/1, el ADH1C*1/1 y el CYP2E1*C/C. No se observaron diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de los genotipos entre los casos y los controles. Se requieren estudios adicionales en población colombiana para evaluar el riesgo de la enfermedad hepática terminal por consumo crónico de alcohol y la asociación con los polimorfismos.

Introduction: One of the most important risk factors for hepatocellular carcinoma (HCC) is alcohol consumption: Studies in different populations suggest that the risk of liver disease could be associated with genetic variants of the enzymes involved in alcohol metabolism, such as alcohol dehydrogenase (ADH) and cytochrome P450 CYP2E1. Objective: To identify and characterize the allelic variants of ADH1B, ADH1C and CYP2E1 genes in Colombian patients with cirrhosis and/or HCC. Materials and methods: We included samples from patients attending the hepatology unit between 2005-2007 and 2014-2016 of a hospital in Medellin. Samples were genotyped using PCR-RFLP. We compared the results with two control groups and the 1000 Genomes Project database. Results: We collected 97 samples from patients with a diagnosis of cirrhosis and/or HCC. The two main risk factors were chronic alcohol consumption (18.6%) and cholangiopathies (17.5%). The most frequent genotypes in the study population were ADH1B*1/1 (82%), ADH1C*1/1 (59%), and CYP2E1*C/C (84%). Conclusions: This first study of polymorphisms in Colombian patients diagnosed with cirrhosis and/or HCC showed genotypes ADH1B*1/1, ADH1C*1/1 and CYP2E1*C/C as the most frequent. We found no significant differences in the genotype frequency between cases and controls. Further studies are necessary to explore the association between polymorphisms and the risk of end-stage liver disease from alcohol consumption.

The patient profile of individuals with Alpha-1 antitrypsine gene mutations at a referral center in Brazil / Perfil dos pacientes com mutação no gene da alfa-1 antitripsina em um centro de referência no Brasil

ABSTRACT Objective: The clinical, functional, radiological and genotypic descriptions of patients with an alpha-1 antitrypsin (A1AT) gene mutation in a referral center for COPD in Brazil. Methods: A cross-sectional study of patients with an A1AT gene mutation compatible with deficiency. We evaluated the A1AT dosage and genotypic, demographic, clinical, tomographic, and functional characteristics of these patients. Results: Among the 43 patients suspected of A1AT deficiency (A1ATD), the disease was confirmed by genotyping in 27 of them. The A1AT median dosage was 45 mg/dL, and 4 patients (15%) had a normal dosage. Median age was 54, 63% of the patients were male, and the respiratory symptoms started at the age of 40. The median FEV1 was 1.37L (43% predicted). Tomographic emphysema was found in 77.8% of the individuals. The emphysema was panlobular in 76% of them and 48% had lower lobe predominance. The frequency of bronchiectasis was 52% and the frequency of bronchial thickening was 81.5%. The most common genotype was Pi*ZZ in 40.7% of participants. The other genotypes found were: Pi*SZ (18.5%), PiM1Z (14.8%), Pi*M1S (7.4%), Pi*M2Z (3.7%), Pi*M1I (3.7%), Pi*ZMnichinan (3.7%), Pi*M3Plowell (3.7%), and Pi*SF (3.7%). We did not find any significant difference in age, smoking load, FEV1, or the presence of bronchiectasis between the groups with a normal and a reduced A1AT dosage, neither for 1 nor 2-allele mutation for A1ATD. Conclusions: Our patients presented a high frequency of emphysema, bronchiectasis and bronchial thickening, and early-beginning respiratory symptoms. The most frequent genotype was Pi*ZZ. Heterozygous genotypes and normal levels of A1AT also manifested significant lung disease.

RESUMO Objetivo: Caracterização clínica, funcional, radiológica e genotípica dos pacientes portadores de mutações do gene da alfa-1 antitripsina (A1AT) em um centro de referência em doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC) no Brasil. Métodos: Estudo transversal de pacientes com mutação no gene da A1AT compatível com deficiência. Foram avaliadas características genotípicas, demográficas, clínicas, tomográficas, de função pulmonar, e dosagem de A1AT. Resultados: De 43 pacientes suspeitos para deficiência de alfa-1 antitripsina (DA1AT), a doença foi confirmada por genotipagem em 27. A mediana da dosagem de A1AT foi de 45 mg/dL, e 4 pacientes (15%) apresentavam dosagens normais. A idade mediana foi de 54 anos, 63% dos participantes eram do sexo masculino e a idade do início dos sintomas prevalente foi aos 40 anos. A mediana do volume expiratório forçado no primeiro segundo (VEF1) foi de 1,37 L (43% do previsto). Enfisema tomográfico foi encontrado em 77,8% dos indivíduos, sendo panlobular em 76% e de predomínio em lobos inferiores em 48%. A frequência de bronquiectasias foi de 52%, e a de espessamento brônquico, de 81,5%. O genótipo mais encontrado foi Pi*ZZ (40,7%). Os demais genótipos foram: Pi*SZ (18,5%), Pi*M1Z (14,8%), Pi*M1S (7,4%), Pi*M2Z (3,7%), Pi*M1I (3,7%), Pi*ZMnichinan (3,7%), Pi*M3Plowell (3,7%) e Pi*SF (3,7%). Não encontramos diferença significativa para idade, carga tabágica, VEF1 e presença de bronquiectasias entre os grupos com dosagem de A1AT normal versus alterada, nem entre 1 alelo versus 2 alelos com mutação para DA1AT. Conclusões: Nossos pacientes apresentaram alta frequência de enfisema, bronquiectasias e espessamento brônquico, com início precoce dos sintomas respiratórios. O genótipo mais frequente foi Pi*ZZ, embora genótipos heterozigotos e níveis normais de A1AT também tenham se manifestado com doença pulmonar significativa.

Association of the SLC6A4 gene 5HTTLPR polymorphism and ADHD with epilepsy, gestational diabetes, and parental substance abuse in Mexican mestizo children / Asociación del polimorfismo 5HTTLPR del gen SLC6A4 y TDAH con epilepsia, diabetes gestacional y adicción de los padres en niños mestizos mexicanos

Abstract Introduction Attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) is one of the most common neuropsychiatric conditions in childhood and a multifactorial condition attributable to genetic and/or environmental influence. Allelic variants in the serotonin transporter gene (SLC6A4) have been associated to lower transcriptional efficiency, changes in serotonin concentration in several brain regions, and ADHD development. Objective To identify the association between the SLC6A4 alleles and ADHD diagnosis and risk factor phenotypes in children from a Mexican mestizo population. Method In this study, 134 unrelated children were included and evaluated for ADHD, genotypification for the 5HTTLPR polymorphism, and identification of multiple phenotypes from their clinical records and family background for association analysis. Results The following distribution of genotypes was observed: 23% SS, 49% SL, and 28% LL. From the phenotypes evaluated in the present study, gestational diabetes mellitus (p = .045), history of epilepsy (p = .047), and parental substance abuse (p = .033) showed an association with ADHD development in regression analysis along with the S variant. Discussion and conclusion Results suggest that interaction of the S allele and some of the phenotypes analyzed may play a relevant role in the development of ADHD in the studied population.

Resumen Introducción El trastorno por déficit de atención e hiperactividad (TDAH) es uno de los padecimientos neuropsiquiátricos más comunes en la infancia. Como su naturaleza es multifactorial, es atribuible a influencias genéticas y/o ambientales. Las variantes alélicas del gen transportador de serotonina (SLC6A4) se han asociado previamente con cambios en los niveles de serotonina en algunas regiones cerebrales, así como con el desarrollo de TDAH. Objetivo Identificar la posible asociación entre los alelos del gen SLC6A4 y el diagnóstico de TDAH, así como factores de riesgo en niños mestizos mexicanos. Método En el presente estudio se incluyeron 134 niños, los cuales fueron evaluados para TDAH, genotipificación del polimorfismo 5HTTLPR e identificación de múltiples fenotipos en su historia clínica y antecedentes familiares para su análisis de asociación estadística. Resultados Se mostró la siguiente distribución de genotipos: 23% SS, 49% SL y 28% LL. En un modelo de regresión, los fenotipos de diabetes mellitus gestacional (p = .045), historia de epilepsia (p = .047) y el abuso de sustancias de los padres (p = .033) mostraron asociación con la variante S y el desarrollo de TDAH. Discusión y conclusión El presente estudio sugiere que el alelo S en conjunto con algunos fenotipos puede cumplir un papel importante en el desarrollo de TDAH en nuestra población.

Polymorphisms in alcohol dehydrogenase (ADH1) and cytochrome p450 2E1 (CYP2E1) genes in patients with cirrhosis and/or hepatocellular carcinoma / Polimorfismos en los genes de la enzima alcohol deshidrogenasa (ADH1) y la citocromo P450 2E1 (CYP2E1) en pacientes con cirrosis y carcinoma hepatocelular

Introduction: One of the most important risk factors for hepatocellular carcinoma (HCC) is alcohol consumption: Studies in different populations suggest that the risk of liver disease could be associated with genetic variants of the enzymes involved in alcohol metabolism, such as alcohol dehydrogenase (ADH) and cytochrome P450 CYP2E1. Objective: To identify and characterize the allelic variants of ADH1B, ADH1C and CYP2E1 genes in Colombian patients with cirrhosis and/or HCC. Materials and methods: We included samples from patients attending the hepatology unit between 2005-2007 and 2014-2016 of a hospital in Medellin. Samples were genotyped using PCR-RFLP. We compared the results with two control groups and the 1000 Genomes Project database. Results: We collected 97 samples from patients with a diagnosis of cirrhosis and/or HCC. The two main risk factors were chronic alcohol consumption (18.6%) and cholangiopathies (17.5%). The most frequent genotypes in the study population were ADH1B*1/1 (82%), ADH1C*1/1 (59%), and CYP2E1*C/C (84%). Conclusions: This first study of polymorphisms in Colombian patients diagnosed with cirrhosis and/or HCC showed genotypes ADH1B*1/1, ADH1C*1/1 and CYP2E1*C/C as the most frequent. We found no significant differences in the genotype frequency between cases and controls. Further studies are necessary to explore the association between polymorphisms and the risk of end-stage liver disease from alcohol consumption.

Introducción. Uno de los principales factores de riesgo del carcinoma hepatocelular es el consumo crónico de alcohol. En estudios en diferentes poblaciones, se sugiere que las variantes genéticas de las enzimas que participan en el metabolismo del alcohol, como la alcohol deshidrogenasa (ADH) y la citocromo P450 (CYP2E1), estarían asociadas con riesgo de enfermedades hepáticas terminales.Objetivo. Identificar y caracterizar las variantes alélicas de los genes ADH1B, ADH1C y CYP2E1 en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular.Materiales y métodos. Se incluyeron muestras de pacientes atendidos entre el 2005 y el 2007, y entre el 2014 y el 2016, en la unidad de hepatología de un hospital de Medellín. La genotipificación de las muestras se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) con análisis de los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Los resultados se compararon con los de dos grupos de control y con lo reportado en la base de datos del 1000 Genomes Project.Resultados. Se recolectaron 97 muestras de pacientes con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Los dos factores de riesgo más frecuentes fueron el consumo crónico de alcohol (18,6 %) y las colangiopatías (17,5 %). Los genotipos más frecuentes en la población de estudio fueron el ADH1B*1/1 (82 %), el ADH1C*1/1 (59 %) y el CYP2E1*C/C (84 %).Conclusiones. En este primer estudio de los polimorfismos en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular, los genotipos más frecuentes fueron el ADH1B*1/1, el ADH1C*1/1 y el CYP2E1*C/C. No se observaron diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de los genotipos entre los casos y los controles. Se requieren estudios adicionales en población colombiana para evaluar el riesgo de la enfermedad hepática terminal por consumo crónico de alcohol y laasociación con los polimorfismos.

Variabilidade genética de 12 loci de microssatélites em galinhas crioulas Canela-Preta / Genetic variability of twelve microsatellite loci in native Canela-Preta chickens

Esta pesquisa foi realizada com o objetivo de se conhecer a variabilidade genética de 12 loci de microssatélites em galinhas crioulas Canela-Preta. Foram coletadas amostras de sangue de 118 galinhas crioulas Canela-Preta, provenientes de três municípios do estado do Piauí (Oeiras, Queimada Nova e Teresina). Após extração do DNA, foram utilizados marcadores para 12 loci de microssatélites: LEI0192, LEI0209, LEI0212, LEI0217, LEI0221, LEI0234, LEI0237, LEI0248, LEI0258, MCW0081, MCW0183 e MCW0213, que foram amplificados pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Foram obtidos 408 alelos (somando os alelos dos 12 loci), com os fragmentos variando entre 50 e 460 pares de bases. O número de alelos variou de 15 (MCW0081) a 52 (LEI0212), com média de 31,5 alelos por locus. A média de heterozigosidade esperada e o conteúdo de informações polimórficas foram, respectivamente, 0,887 e 0,909. Foram observados desvios no equilíbrio de Hardy-Weinberg e valores positivos do índice de fixação com excesso de homozigotos. Os microssatélites utilizados mostraram-se polimórficos e podem ser usados para investigações genéticas em galinhas Canela-Preta. As galinhas dos plantéis avaliados apresentam grande variabilidade gênica, o que as qualifica como importante fonte de recursos genéticos e, consequentemente, faculta a utilização delas em programas de melhoramento genético animal.(AU)

The aim of this study was to analyze the genetic variability of twelve microsatellite loci in native Canela-Preta chickens. Blood samples were collected from 118 chickens of the breed from five properties in three cities (Oeiras, Queimada Nova and Teresina) of Piauí state. After the DNA extraction, markers were used for twelve microsatellite loci: LEI0192, LEI0209, LEI0212, LEI0217, LEI0221, LEI0234, LEI0237, LEI0248, LEI0258, MCW0081, MCW0183, and MCW0213 that were amplified by polymerase chain reaction technique (PCR). The results showed a total of 408 alleles (adding alleles from the 12 loci) with the fragments ranging between 50 and 460 base pairs, the number of alleles ranged from 15 (MCW0081) to 52 (LEI0212) with an average of 31,5 alleles per locus. The average expected heterozygosity and PIC were, respectively, 0.887 and 0.909. Deviations were observed in the Hardy-Weinberg equilibrium and positive values of the fixation index with excess of homozygotes. It is concluded that the used microsatellites are polymorphic and can, therefore, be used for genetic research in Canela-Preta chickens. The birds of the analyzed cores present great genetic variability, which qualifies them as an important source of genetic resources, which could be used for future animal breeding programs.(AU)

Asociación de los polimorfismos T352C y A16974C con la lepra lepromatosa en pacientes cubanos / Association of T352C and A16974C polymorphisms with lepromatose leprosy in cuban patients

Introducción: La Lepra es una enfermedad infecciosa causada por el Mycobacterium leprae. Los patrones dermatoglíficos de pacientes cubanos con lepra lepromatosa mostraron indicios probatorios de que existe predisposición genética para el desarrollo de esta enfermedad, que sugiere la búsqueda de la asociación con polimorfismos moleculares, de mayor precisión. Entre estos, unos de los más estudiados son el T352C del gen del receptor de la vitamina D y el A16974C del gen IL12p40, cuya utilidad relativa depende de la población. Objetivo: Determinar si existe asociación entre la presencia de los polimorfismos T352C y A16974C con la lepra lepromatosa en pacientes cubanos. Material y Métodos: Se realizó un estudio observacional, analítico, de tipo caso-control de asociación genética donde se estudiaron pacientes con lepra lepromatosa y controles. Fueron identificados los genotipos relacionados con los polimorfismos T352C y A16974C en cada grupo. La prueba Chi-cuadrado de Pearson fue utilizada para determinar si los controles se hallaban en equilibrio de Hardy Weinberg, así como si existía relación entre los polimorfismos y la presencia de la enfermedad. Resultados: Los pacientes estudiados fueron 32 para el polimorfismo T352C y 44 para el A16974C. Los controles fueron 64 y 44, respectivamente; estos se hallaron en equilibrio Hardy-Weinberg. No se detectó asociaciónentre los polimorfismos A16974C y T352C con la lepra lepromatosa. Conclusiones: Los polimorfismos T352C y A16974C no son útiles como factor de riesgo predisponente en el grupo de pacientes cubanos con lepra lepromatosa estudiados(AU)

Introduction: Leprosy is an infectious disease caused by Mycobacterium leprae. Dermatoglyphic patterns of Cuban patients with lepromatose leprosy showed evidential signs of the existence of genetic predisposition to the development of this disease, which suggests a search for the association with molecular polymorphisms of higher degree of accuracy. Among them, some of the most studied are the T352C vitamin D receptor gene and the A16974Cof the IL12p40 gene, which relative usefulness depends on the population. Objective: To determine whether there is an association between the T352Cand A16974C polymorphisms with lepromatose leprosy in Cuban patients. Material and methods: An observational analytical case-control type genetic association study was conducted where patients with lepromatose leprosy and controls were studied. Genotypes related to T352Cand A16974C polymorphisms were identified in each group. Pearson´s chi square test was used to determine whether the controls were in Hardy-Weinberg equilibrium, and also whether there was a relation between polymorphisms and the presence of diseases. Results: There were 32 patients under study for T352C polymorphism, and 42 for A16974C. The controls were 64 and 44, respectively; and these were in Hardy-Weinberg equilibrium. No association between T352Cand A16974C polymorphisms with lepromatose leprosy was detected. Conclusions: T352Cand A16974C polymorphisms are not useful as a predisposing risk factor in the group of Cuban patients with lepromatose leprosy studied(AU)

Frequency of classes I and II HLA alleles in deceased donors of solid organs in Espírito Santo, Brazil / Frequência alélica HLA de classes I e II em doadores falecidos de órgãos sólidos no Espírito Santo, Brasil

ABSTRACT Introduction: The Brazilian population has a great racial mix, originating mainly from Europeans, Africans and Indians. Human leukocyte antigens (HLA) specificities vary among different population and ethnic groups, since they demonstrate greater similarity in populations of common origin. Objective: To determine the genetic structure of HLA classes I and II alleles in deceased donors of solid organs in the state of Espírito Santo, Brazil, from 2011 to 2015. Methods: The present study covered 208 brain-dead donors of solid organs, from 2011 to 2015, in the state of Espírito Santo, Brazil. HLA typing was performed by polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes (PCR-SSP) using kits for generic classes I and II SSP DNA typing test, A, B and DR loci. Results: The profile of deceased donors found in Espírito Santo, Brazil, in the period from 2011 to 2015, was brown men, aged over 40 years. The most frequent HLA alleles were A2 (24.28%), B44 (10.34%) and DR15 (14.18%); and the least frequent, A43 (0.24%), B46, B47, B70, B75 and B78 (0.24%) and DR9 (1.68%), DR12 and DR18 (2.16%). Conclusion: The present study contributed with significant information about the frequency of HLA antigens in deceased donors of solid organs in the Brazilian population that will contribute to optimize the transplantation process in the country.

RESUMO Introdução: A população brasileira possui grande mistura racial, tendo sido originada, principalmente, de caucasoides de origem europeia, africanos e índios. As especificidades do sistema de antígenos leucocitários humanos (HLA) variam entre os diferentes grupos populacionais e étnicos, uma vez que demonstram maior similaridade entre populações com origem comum. Objetivo: Determinar a estrutura genética dos alelos HLA de classes I e II em doadores falecidos de órgãos sólidos no Estado do Espírito Santo, Brasil, no período de 2011 a 2015. Métodos: O presente estudo foi realizado em 208 indivíduos falecidos doadores de órgãos sólidos, diagnosticados com morte encefálica, no período de 2011 a 2015, no estado do Espírito Santo, Brasil. A tipificação HLA foi realizada pela técnica de reação em cadeia da polimerase-iniciador específico único (PCR-SSP) utilizando kits para teste de tipagem de ácido desoxirribonucleico (DNA) por SSP genérico de classes I e II, loci A, B e DR. Resultados: O perfil dos doadores falecidos encontrados no Espírito Santo, Brasil, no período de 2011 a 2015, foi de homens pardos, com faixa etária acima de 40 anos. Os alelos HLA mais frequentes foram A2 (24,28%), B44 (10,34%) e DR15 (14,18%); e os menos frequentes, A43 (0,24%), B46, B47, B70, B75 e B78 (0,24%) e DR9 (1,68%), DR12 e DR18 (2,16%). Conclusão: O presente estudo contribuiu com significativas informações acerca da frequência dos antígenos HLA em indivíduos falecidos doadores de órgãos que poderão otimizar o processo de transplantes no país.